保存しているはずなのにテーマが再起動時に初期化されてしまう場合。
どうも、Foreground / Backgroundが設定されているのが問題らしい。
というか、内部の設定はなんか安定しないので、次のように初期化スクリプトで指定するのが一番確実というか楽。
(load-theme 'solarized-dark t)
